本文首次采用单引物富集技术(SPET)对来自欧洲、美洲和亚洲10个国家的160份莴苣材料的遗传多样性进行了研究,并确定了重要农艺性状的基因组区域。
近年来,研究作物基因组多样性的技术取得了惊人的进展,单引物富集技术(SPET)等新方法为研究作物基因组多样性提供了前景广阔且具有成本效益的机会。迄今为止,SPET已在玉米、杨树、油棕、番茄、茄子和桃子等几种作物植物中得到应用,显示出其在种质资源收集和种群杂交方面的能力。
在欧洲植物遗传资源合作计划(ECPGR)的欧洲评估网络(EVA)的背景下,欧洲研究人员首次将SPET应用于莴苣(Lactuca sativa L.),目的是研究其遗传多样性并确定支撑重要农艺性状的基因组区域。
生菜是一种重要的商业作物,因其纤维含量高、热量低而广受消费者欢迎。它也是维生素C、铁、叶酸和各种有益健康的营养素的良好来源。
该研究的主要作者、意大利CREA的高级研究员Pasquale Tripodi说:“鉴于缺乏具有成本效益的生菜基因分型选择,EVA网络决定与IGATech一起为这种作物设计一个SPET面板,并将其应用于155种莴苣和5种密切相关的野生莴苣。”
EVA倡议是由ECPGR于2019年建立的,旨在提高对作物遗传多样性的认识,并利用它培育出更具抗逆性的作物,以解决农业面临的主要问题。
EVA项目协调员、该研究的合著者Sandra Goritschnig解释说:“EVA莴苣网络是目前五个特定作物的公私合作伙伴关系之一,它将育种公司、基因库和研究机构聚集在一起,共同为欧洲基因库中可用的众多品种和地方品种生成表型和基因型评估数据。”
本研究中的植物材料是在EVA莴苣网络框架内选择的,来自四个欧洲基因库的种质资源收集:保加利亚植物遗传资源研究所“K.Malkov”、荷兰遗传资源中心、gsamnsamiclivation、植物生物学和育种、INRAe(法国)和北欧遗传资源中心(NordGen)(瑞典)。
所研究的基因型包括来自欧洲、美洲和亚洲10个不同国家的栽培品种、育种材料和地方品种,包括不同的园艺类型,如Butterhead、Iceberg、Romaine、Batavia、Crisp,并在三个国家的多地点田间试验中进行了表型分析。
为什么SPET ?
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